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劳动卫生与环境卫生学学科

訾晓渊

1.基本信息

    訾晓渊,男,1976年出生,博士,副教授,硕士生导师,上海市“浦江人才”、江苏省“双创人才”和南京市“紫金山英才”,曾荣立个人三等功一次。新格元生物科技有限公司高级研发副总裁、郑州大学公共卫生学院硕士生导师。主要研究方向为单细胞的功能、 基因组学、肝干细胞的基础与临床转化等领域。

2.教育经历

1999.9-2004.6,第二军医大学细胞生物学,博士学位。

1994.9-1999.6,第二军医大学临床医学,学士学位。

3.科研与学术工作经历

2021.1-至今,新格元生物科技有限公司,高级研发副总裁

2018.7-2020.12,新格元生物科技有限公司,研发副总裁

2015.5-2018.6,耶鲁大学医学院癌症中心,访问学者

2013.6-2016.4,上海长海医院泌尿外科实验室,主任/副教授

2014.3-2014.7,耶鲁大学,副研究员

2012.2-2014.2,耶鲁大学,博士后

2008.7-2018.6,第二军医大学,副教授

2004.6-2008.6,第二军医大学,讲师

4.主要学术荣誉和学术兼职

4.1学术荣誉

(1)2022.1 紫金山英才先锋计划   中共南京市委人才工作领导小组

(2)2019.10 江苏省“双创人才”  江苏省人才工作领导小组办公室等

(3)2016.8 上海市浦江人才计划   上海市人社局&上海市科技局

4.2学术兼职

(1)中国细胞生物学会会员

(2)教育部学位与研究生教育评估工作评审专家

(3)国家自然科学基金项目评审专家

5.主持或参加科研项目(课题)情况

(1)中共南京市委人才工作领导小组,南京市紫金山英才先发计划, 海量单细胞测序系列临检产品的研发,2021-2024年,150万元,在研,主持

(2)江苏省人才工作领导小组办公室,江苏省双创人才,海量单细胞测序微流控芯片前处理系列临检产品的研发, 2020-2022年,80万元,结题,主持

(3)上海市人社局&上海市科技局, 上海市浦江计划,环状RNA在前列腺癌早期诊断和分子分型中的应用研究,2016-2018年,20万元,结题,主持

(4)国家自然科学基金委员会,自然科学基金,面上项目,Tet 家族在小鼠成纤维细胞诱导为肝干细胞的谱系重编程过程中的作用及相关机制研究,2015-2018年,85万元,结题,参加

6. 个人研究领域

(1)转基因小鼠的制备和应用研究;

(2)乙肝相关疾病的研究;

(3)肝干细胞治疗的基础和临床研究;

(4)研制了一种细胞裂解液,为进行单细胞转录组和基因组分析奠定了基础;

(5)合作建立了可同时扩增单细胞转录组和基因组的微流控系统;

(6)建立了能在常规实验室开展的单细胞和少量细胞转录组和基因组研究体系,并与哈佛大学Dana-Farber肿瘤研究所、耶鲁大学免疫系和干细胞中心的5个实验室合作,在细胞重编程、干细胞、免疫学和肿瘤学等方面得到了很好的推广应用;

(7)单细胞测序产品的开发、优化和验证;单细胞测序自动化技术体系的开发和优化。

7.代表性研究成果

7.1 代表性论文

期刊论文

(1)Single symbiotic cell transcriptome sequencing of coral.Minli Li, Hongde Liu , Yunxia,Guo,Fang Chen ,Xiao yuan Zi , Rong Fan, Huamei Li, Yiran Cai, Chunpeng He, Zuhong Lu, Xiangwei Zhao,Genomics,2020.

(2) Immune Escape in Breast Cancer During In Situ to Invasive Carcinoma Transition.Gil Del Alcazar CR, Huh SJ, Ekram MB, Trinh A, Liu LL, Beca F, Zi X, Kwak M, Bergholtz H, Su Y, Ding L, Russnes HG, Richardson AL, Babski K, Min HuiKim E, McDonnell CH 3rd, Wagner J, Rowberry R, Freeman GJ, Dillon D, Sorlie T, Coussens LM, Garber JE, Fan R, Bobolis K, Allred DC, Jeong J, Park SY, Michor F, Polyak K,Cancer Discov,2017.

(3) Interplay between genome and epigenome of prostate cancer.Jing Li, Chuanliang Xu, Xu Gao, Hyung Joo Lee, Shancheng Ren , Xiaoyuan Zi, Zhiming Zhang , Haifeng Wang , Yongwei Yu,Nature,2019

(4)Perturbed myoepithelial cell differentiation in BRCA mutation carriers and in ductal carcinoma in situ.Ding L, Su Y, Fassl A, Hinohara K, Qiu X, Harper NW, Huh SJ,Bloushtain-Qimron N, Jovanović B, Ekram M, Zi X, Hines WC, Alečković M, Gil Del Alcazar C,Nat Commun,2019.

(5)Bisulfite-independent analysis of CpG island methylation enables genome-scale stratification of single cells.Han L, Wu HJ, Zhu H, Kim KY, Marjani SL, Riester M, Euskirchen G, Zi X, Yang J, Han J,Nucleic Acids Res.2017.

7.2专利

(1) 訾晓渊;一种具有分子标签序列的磁性微球及其制备方法,中国ZL202010938623.9(申请中)

(2) 訾晓渊;一种FFPE样本预处理液及从FFPE样本中分离单细胞的方法,中国ZL202110197602.0(申请中)

(3) 訾晓渊;一种单细胞裂解液及其应用,中国ZL202110197600.1(申请中)

(4) 訾晓渊;适用于高通量单细胞转录测序的前处理方法,中国ZL202110854674.8(申请中)

(5) 訾晓渊;一种高通量单个免疫细胞表面受体核酸序列检测方法,中国ZL202110855306.5(申请中)

(6) 訾晓渊;一种基于微流控芯片的单细胞mRNA逆转录方法,中国ZL202110855320.5(申请中)

7.3著作

(1)《高级细胞生物学》,研究生自编教材,副主编,2013

(2)《细胞生物学与细胞工程》,研究生自编教材,主编,2011

(3)《细胞生物学与细胞工程实验指导》,研究生自编教材,主编,2011

(4)《细胞工程》,第二军医大学生物技术专业本科自编教材,主编,2010

(5)《医学细胞生物学(第7版)》, “十二五”国家级规划教材,科学出版社,参编,2015

(6)《医学生物学(第8版)》, “十二五”规划教材,科学出版社,参编,2015

(7)《医学细胞生物学(第6版)》, “十二五”国家级规划教材,科学出版社,参编,2011

(8)《医学生物学(第7版)》, “十二五”国家级规划教材,科学出版社,参编,2011

(9)《医学细胞生物学学习指导及习题集(第2版) 》,“十二五”国家级规划教材,科学出版社,参编,2011

(10)《医学生物学学习指导及习题集(第2版) 》,“十二五”国家级规划教材,科学出版社,参编,2011

(11)《医学细胞生物学(第5版)》, “十一五”国家级规划教材,科学出版社,参编,2007

(12)《医学生物学(第6版)》, “十一五”国家级规划教材,科学出版社,参编,2007

 

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